Ύστερα από τις αποφάσεις της Πειθαρχικής Επιτροπής της ΕΠΟ για τον επανορισμό αγώνων της 3ης φάσης του Κυπέλλου Ελλάδας, το πρόγραμμα της 1ης και της 2ης αγωνιστικής συμπληρώνεται και αναμορφώνεται ως εξής
1η αγωνιστική
Λεβαδειακός-ΑΕΚ: 25/1/2017, ώρα 15:00, Λιβαδειάς
Λαμία-Ατρόμητος: 25/1/2017, ώρα 17:15, ΔΑΚ Λαμίας
Άρης-Ολυμπιακός: 25/1/2017, ώρα 19:30, Κλ. Βικελίδης
Ξάνθη-ΟΦΗ: 24/1/2017, ώρα 17:15, Ξάνθη Arena
Πλατανιάς-ΠΑΣ Γιάννινα: 26/1/2017, ώρα 17:15, Περιιβολίων
2η αγωνιστική
Αστέρας Τρίπολης-Τρίκαλα: 25/1/2017, ώρα 17:15, Θ. Κολοκοτρώνης
ΠΑΟΚ-Παναιτωλικός: 26/1/2017, ώρα 19:30, Τούμπας
Κισσαμικός-Παναθηναϊκός: 1/2/2017, ώρα 15:00, Περιβολίων